Arquitecte graduat a la Universitat Politècnica de Milà i doctorat a l’Institut Universitari d’Arquitectes de Venècia. Interessat pel medi ambient, va fundar Multiplicity, una agència dedicada a la investigació de l’entorn físic formada per arquitectes, geògrafs, artistes, urbanistes, fotògrafs, sociòlegs, economistes i cineastes, entre altres perfils professionals, amb l’objectiu de crear estratègies d’intervenció i estudi del món urbà. És fundador també de la plataforma theTomorrow per a la promoció i l’intercanvi d’idees sobre art, migració, educació i creativitat de diferents cultures.

L’any 2008 va crear Stefano Boeri Architetti (SBA), amb seu a Milà i oficines a Xangai i Tirana. L’estudi es dedica tant a la investigació com a la pràctica de l’arquitectura i urbanisme. Un dels seus projectes més importants és el conegut “Bosc Vertical a Milà” (2014), guardonat amb el High Rise Building del Museu d’Arquitectura de Frankfurt el 2014 i el CTBUH Award el 2015 com el Millor Edifici Alt. El treball de Boeri ha estat publicat a Domus, ICON, Lotus, 2G, Rússia Project, MIT Press, Harvard Design Magazine i Corriere della Sera, entre altres mitjans.